Merhabalar, anladığım kadarıyla şöyle bir mantıkta ilerliyorsunuz.

foreach(...){

   $site = file_get_html('website');
   vs
   vs
}

Dokümantasyona biraz baktım ama kullandığınız kütüphanede 'file_get_html' nasıl bir error dönüyor yazmamıyor yada ben göremedim.
Varsayalım ki false dönüyor.

$notFound = [];
foreach(...){

   $site = file_get_html('website');
   if($site){
       array_push($notFound, 'website');
       continue;
   }
   vs
   vs
}

Bu mantıkta olmayan website False dönecek ve if kısmına girecek. '$notFound' adlı arrayimizde aktif olmayan siteleri push edip continue diyerek döngüde geri kalan işlemleri yaptırmadan başa almış olacağız.
Umarım anlatabilmişimdir. İyi çalışmalar.