CHMOD ayarı olarak geçiyor, RWX yani read (okuma), write (yazma) ve execute (çalıştırma) izinlerini temsil eder.

Örnek vermek gerekirse:

Owner.   Group.   Public
---      ---      ---
rwx.     rwx.     rwx

Yukarıdaki gibi bir değerin karşılığı 777 dir.

Çünkü üç gruba da okuma, yazma ve çalıştırma izni veriliyor.

Atıyorum 444 olsaydı, bütün grupba sadece okuma izni verilmiş olurdu. Ya da 400 olsaydı sadece sahibi okuyabilir geriye kalan kimse işlem yapamaz olurdu. 700 olsaydı sahibi okuyabilir, yazabilir ve çalıştırabilir diğer gruplar hiçbir şey yapamazdı. Bu mantıkta PHP tarafında da dosya yazamama ya da mevcut dosyayı güncelleyememe gibi durumlar olabilir.

Bu hesapları daha kolay yapmak için şuraya gözatabilirsin:
https://chmod-calculator.com/