Merhaba, daha önce bu sorunla ilgili ben - çok efektif bir çözüm olmasa da - modal açıldığında videoyu js ile ekleyip kapandığında ise videoyu kaldıran bir sistem eklemiştim.
Belki senin işine yarar. Fikir vermesi adına benzer bir kodu aşağıda paylaşıyorum.

 function embedVideo(videoId){ 
     $('#video').remove();
     var youtubeLink = "https://www.youtube.com/embed/"+videoId;
     $('div.modal-body').append('<iframe id="video" width="100%" height="600px" src="' + youtubeLink + '" frameborder="0" allow="autoplay; fullscreen" allowfullscreen></iframe>');
     $('#myModal').modal('show');
     //Bootstrap modal kapanma eventi
    $('#myModal').on('hidden.bs.modal', function () {
        $('#video').remove();
    });
 }

Ayrıca kapatma tuşu veya çarpı tuşu gibi tuşlara tıklandığında da iframe'i kaldıracak bir js yazarsan sorunu çözersin gibi.