güvenlik için html'i replace ediyor codeigniter, yapabileceğin en basit çözüm htmlspecialchars_decode() ve strip_tags() kullanmak olabilir. Belki Codeigniter'da bunun için bir metod ya da fonksiyon vardır ancak bilmiyorum. Şöyle deneyebilirsin;

<?=substr(strip_tags(htmlspecialchars_decode($key->description)), 0, 50)?>