1) Nesne yapısına hakim değilim. Php'de "$data" dan sonra kullanılan yapıyı bilmiyorum. Prosedür "mysqli_query" tarzında yazabilirseniz ilerleyebilirim.

Veritabanından size nasıl bir sonuç dönüyor bilemiyorum. Örnek vererek ilerleyebilirim:

$sorgu = "SELECT ekle_ad, ekle_ozellik FROM tablom";
$sonuc = mysqli_query($sorgu);
if (!$sonuc) die("Sorgu çalıştırma hatası: " . mysqli_error());

$datas = [];
while ($row = mysql_fetch_assoc($sonuc)) $datas[] = $row;

Aldığınız veriyi, benim örnek verdiğim $datas değişkenine bu şekilde doldurabilirsiniz.
Böylece $datas değişkeniniz şöyle bir değer almış olacak:

$datas = [
    ["ekle_ad" => "yazilimyolcusu", "ekle_ozellik" => "Veri 1"],
    ["ekle_ad" => "yazilimyolcusu", "ekle_ozellik" => "Veri 3"]
];

Bu bir object'ler array'i. Object'lerin aslında array'den pek farkı yok.
Array'lerde index no ile seçim yaparsınız. Object'lerde ise key'lerle seçim yaparsınız.

Örn. $datas dizisindeki ilk elemanı almak için: $datas[0]
Örn ilk elemandaki "ekle_ad" key'inin değerini almak için: $datas[0]->ekle_ad

2) Bir sorum olacak. Bu "checkbox_attr" değişkenlerini input'un içinde bu şekilde mi kullanacağız?
Evet. Amacınız, seçili checkbox'a checked özelliği eklemek. Bunu nasıl yapacağınız size kalmış. Benim gösterdiğim bir yol sadece.