daha farklı mantıklarda vardır tabi ama ben 2 farklı yol düşündüm

öncelikle javascript kodlarımız bu şekilde olsun

setInterval(function(){
    $.get('ajax.php?type=keep_alive');
},60000 * 2); // 2 dakika

içerikte sadece o anki session,cookie tabloda last_activity_time ı güncellicek
update user set last_activity_time = now() where id = x

-1. yol kullanıcıları listediğin yerde o kullanıcı garanti olsun diye 5 dakikadan büyükse offlinedır
-2. ajaxda tablodaki status durumunu güncelledikten sonra bir cron yazıp 5 dakikadan büyük olanları 0 a çekebilirsin

ajax istekleri sürekli sürekli sekme değiştirmeyen bir insan için bilgisayarda performans kaybına neden olabilir

yine de en sağlıklı nodejs socket kullanman olur